上海应用技术大学研究生教育是一所以工科为主，工、理、文、法、经、管、农协调发展的多科性院校。上海应用技术大学在职研究生培养有4个一级学科硕士授权点：化学工程与技术、机械工程、生态学、管理科学与工程。上海应用技术大学非全日制研究生硕士专业学位授权点：化学工程、轻工技术与工程和安全工程。12个二级学科硕士点：化学工程、生物化工、应用化学、工业催化、香料香精技术与工程、材料化学工程、制药工程、机械制造及其自动化、机械电子工程、机械设计及理论、仿生装备与控制工程、车辆工程。

上海应用技术大学研究生招生规模不断扩大，在校硕士研究生已达1139名，上海应用技术大学逐步调整了研究生与本科生的层次结构，非全日制研究生整体分布比较合理，特别是通过在职研究生招生微调，逐步优化硕士研究生专业分布，增加专业硕士的招生比例，与全国研究生招生理念相一致促进学校向高层次应用技术型大学迈进。上海应用技术大学研究生就业单位所属行业主要集中在化工业、生物制药业、高等学校和科研机构，专业对口率达80%以上。总体来说，研究生毕业生就业率高于上海市属高校平均水平，为长三角地区的经济建设作出了积极贡献。

上海应用技术大学研究生导师队伍建设不断加强，学校现有博士研究生导师23人，硕士生导师408名（含150余名兼职导师），导师82%具有博士学位，同时超过55%的导师年龄在45岁以下，具有高级职称的硕士研究生导师占9成以上，已经发展成一支高素质、高学历、高职称和年轻化的硕士生导师队伍，这位我校未来的研究生教育的发展提供了必要的师资条件。