重庆医科大学非全日制研究生具有“学士-硕士-博士-博士后”完整人才培养体系和拥有一批国家级重点学科、省部级重点学科、重点实验室、研究所（室）等科研基地的重庆市重点大学。有国家级重点学科4个，即：内科学（传染病）、儿科学、神经病学、临床检验诊断学，重庆市市级重点学科29个。国家工程研究中心1个，省部共建国家重点实验室3个，省级重点实验室15个（市科委3个、市教委6个、市卫生局6个）。有11个研究所，20个研究室（中心）。博士后流动站3个：生物医学工程、临床医学、药学。一级学科博士学位授权点2个，二级学科博士学位授权点26个，博士生导师185名；一级学科硕士学位授权点6个，二级学科硕士学位授权点53个。
重庆医科大学非全日制研究生下设基础医学院、临床学院、第二临床学院、儿科学院、口腔学院、护理学院、中医药学院、应用技术学院、公共卫生学院、管理学院、药学院等12个学院和8个系（部）、1所卫生学校；附属综合医院2所，儿童医院1所，均为三级甲等医院；附属口腔医院一所，是重庆市最好的口腔专科医院，附属第三医院正在筹建规划阶段。附属医院共有病床2665张，年门诊量2637万余人次，年收治住院病人9.7万余人次。非直管附属医院4所，教学及实习医院22所。
在校学生2万余人，其中博士、硕士生研究生3100余人，普通本、专科生（高职）14804人，成教本专科生3825人，留学生311人。在职的4823名教职工中，有教授、主任医师等正高级专业技术人员267人；副教授、副主任医师等副高级专业技术人员774人；讲师、主治医师等中级专业技术人员1580余人。教师中入选教育部“长江学者和创新团队发展计划”1人；“全国杰出专业技术人才”1人；学校先后承担了国家“六五”至“十五”科技攻关项目及国家自然科学基金重点和面上项目、863、873、973计划项目、国家杰出青年基金项目、国家新药基金项目、教育部跨世纪人才基金项目等高层次科技项目，同时还承担国际合作项目的研究。执行各级科研项目800余项，在国内外学术刊物上公开发表论文1903余篇。据中国科技信息研究所、信息分析中心关于论文检索结果的分析报告获悉，我校在国内重要期刊发表论文排序居全国各类高校第42位。学校公开出版有《重庆医科大学学报》、《中华肝脏病杂志》、《临床超声医学杂志》、《儿科药学杂志》和《医学教育探索》等刊物，面向国内外公开发行。获国家科技进步奖、技术发明奖及部、委、省等各级科技成果奖520项。获国家发明专利等各类专利26项。我校研制的聚焦超声肿瘤治疗系统（超声聚焦刀）属世界首创，在全国科技奖励大会上荣获国家技术发明二等奖，是我国第一台具有完全自主知识产权的大型医疗仪器，临床效果显著，已实施产业化，已在全国30余家大型医院投入使用，并出口英国、日本、韩国、新加坡等国家，在国内外引起很大反响。
改革开放以来，学校共选派1000余人次赴美、英、加、日、俄、法、德、澳、荷兰、瑞士等国家及香港地区进修、留学、参加学术交流；邀请了272批800人次的外国专家教授来校讲学访问；聘请了98位来自美、日、法、德、澳及香港地区的医学专家为我校名誉教授或客座教授。先后有45名来自美、加、英、澳等国的语言专家为我校外语教师。
随着国家关于西部大开发和“科教兴国”战略的进一步实施，重庆医科大学将站在新的历史起点上，肩负新的历史使命，抓住机遇，迎接挑战，开拓创新，与时俱进，为建设成国内一流医科大学而努力奋斗。