学校1985年开始培养硕士研究生，1990年获得硕士学位授予权。目前硕士生指导教师300余人，在校硕士生2000余人。

目前拥有14个一级学科硕士学位授权点：马克思主义理论、物理学、机械工程、仪器科学与技术、材料科学与工程、动力工程及工程热物理、电气工程、计算机科学与技术、土木工程、食品科学与工程、软件工程、应用经济学、设计学、工商管理，下设51个二级学科硕士学位授权点;3个独立二级学科硕士学位授权点：外国语言学及应用语言学、应用数学、信号与信息处理;5个硕士专业学位类别：工程硕士、翻译硕士、社会工作硕士、法律硕士、农业硕士，其中工程硕士有10个领域：计算机技术、材料工程、机械工程、动力工程、水利工程、电气工程、车辆工程、控制工程、建筑与土木工程、制药工程。

拥有8个省重点学科：流体机械及工程(重中之重)、机械电子工程(重中之重)、车辆工程(重中之重)、材料加工工程、电力电子与电力传动、计算机软件与理论、企业管理、食品科学。

拥有1个教育部重点实验室：流体及动力机械;3个省“2011”协同创新中心：汽车关键零部件、能源动力重大装备及技术、四川省食品质量与安全;2个省重点实验室：汽车测控与安全、流体机械及工程;2个省哲社重点研究基地：地方文化资源保护与开发研究中心、学术成果分析与应用研究中心;2个省行业协同创新中心：汽车安全、泵; 13个省高校重点实验室：流体机械、汽车工程、特种材料及制备技术、信号与信息处理、制造与自动化、食品生物技术、高性能科学计算、绿色建筑与建筑节能、智能技术与网络信息处理、汽车高性能材料及成形技术、数字空间安全保障、粮油工程与食品安全、电力电子节能技术与装备; 3个省高校哲社重点研究基地：科技金融与创业金融研究中心、工业设计产业研究中心、新农村乡风文明建设研究中心;1个省区域与国别重点研究基地：澳大利亚研究中心; 5个省高校工程研究中心：工程结构健康检测与加固、耐磨减摩表面技术、包装行业企业信息化、传统发酵食品标准化与质量控制、道路交通安全与车辆事故再现;4个其它厅局级学科平台：四川省旅游景区管理研究基地、四川省知识产权教育培训西华大学基地、四川省质检局汽车产品实验中心、中药生物技术国家二级实验室。

学校设有一批重点研究中心(所)：无线电管理技术研究中心、先进材料及能源研究中心、先进计算研究中心、西华大学-安德里茨国际水力机械研究中心、农业机械工程研究所。